从6月28日下午上线至7月6日24时，国务院联防联控机制在国家卫健委官方网站设置的公众留言板，共收到了13916条违反“九不准”的投诉，涉及全国31个省（区、市）和新疆生产建设兵团。
6月5日，为了进一步提高新冠肺炎疫情防控措施的科学性、精准性和针对性，国务院联防联控机制公布了“九不准”。这“九不准”包括：一、不准随意将限制出行的范围由中、高风险地区扩大到其他地区。二、不准对来自低风险地区人员采取强制劝返、隔离等限制措施。三、不准随意延长中、高风险地区及封控区、管控区的管控时间。四、不准随意扩大采取隔离、管控措施的风险人员范围。五、不准随意延长风险人员的隔离和健康监测时间。六、不准随意以疫情防控为由拒绝为急危重症和需要规律性诊疗等患者提供医疗服务。七、不准对符合条件离校返乡的高校学生采取隔离等措施。八、不准随意设置防疫检查点，限制符合条件的客、货车司乘人员通行。九、不准随意关闭低风险地区保障正常生产生活的场所。
违反“九不准”的防控措施是民众反映强烈的痛点问题。国家卫健委新闻发言人、宣传司副司长米锋说：“对于违反‘九不准’的问题线索，我们将认真汇总整理，督促地方尽快整改，对典型案例将进行曝光。”
国务院联防联控机制梳理公众留言板投诉信息发现，6月29日的投诉量最多——4850条。之后，投诉量逐日递减。7月6日，共收到431条投诉。“随着整治‘层层加码’工作专班的跟踪督办，31个工作组的现场督导和各省份对照新冠肺炎第九版防控方案持续整改，投诉量整体呈现下降趋势。”国家卫健委监督局副局长程有全分析说。
对来自低风险地区人员采取强制劝返、隔离等限制措施的投诉占比最高
13916条投诉中，违反“九不准”第二项“对来自低风险地区人员采取强制劝返、隔离等限制措施”占比最高（31%）。随后是“随意将限制出行的范围由中、高风险地区扩大到其他地区”和“随意扩大采取隔离、管控措施的风险人员范围”，占比分别为24%和15.5%。
6月24日，国务院联防联控机制通报的违反“九不准”的典型案例中，就有对低风险地区人员“层层加码”的情况：青海省对低风险地区返青人员要求提前24小时填报信息，抵青后进行落地核酸检测，返回居住社区后，工作人员上门贴封条，完成三天两检且核酸检测阴性后，方允许出门。
国家卫健委疾控局副局长、一级巡视员雷正龙表示：“（上述）做法不符合国家疫情防控政策要求，目前已按要求开展整改。其他地区要引以为戒，认真做好自查核查工作。”一些地区对低风险地区人员限制出行，采取“一刀切”的隔离管控措施，有些地方还随意延长风险人员的隔离管控期限，严重影响了人们正常出行和经济社会活动。
国务院联防联控机制要求各地要按照“九不准”切实保障人民群众安全有序出行，科学精准做好疫情防控工作，并提出三项具体要求：一是疫情防控后精准划定中、高风险地区的范围，不得随意将限制出行范围由中、高风险地区扩大到其他地区。二是要落实国家规定政策要求，对入境人员、密接、次密接，还有解除闭环管理的高风险岗位人员等风险人员采取相关的管控措施，不准对来自低风险地区人员采取强制劝返、隔离等限制措施。三是严格落实风险人员隔离和健康监测的期限要求，不能随意延长风险人员隔离和健康监测时间。
除了涉及“九不准”的相关投诉，6月24日，国务院联防联控机制还通报了两起在整改范畴的典型案例：辽宁省朝阳市、锦州市高铁站对持有48小时核酸检测阴性结果证明的乘客，仍要求再做核酸检测，并收取乘客19元费用。
对违反“九不准”投诉的办结率达83.7%
“九不准”公布以后，国务院联防联控机制成立了整治“层层加码”问题的专班，这个专班由教育部、工业和信息化部、交通运输部、农业农村部、商务部、文化和旅游部、国家卫健委、海关总署、市场监管总局、国家邮政局等部门组成。
7月8日，国务院联防联控机制新闻发布会再次召开，宣布新增两个整治“层层加码”问题专班的成员单位——民航局和国铁集团。
整治“层层加码”问题专班主要是专项整治疫情防控简单化、“一刀切”“层层加码”等突出问题。国务院联防联控机制要求各省联防联控机制比照国务院联防联控机制综合组专班的架构，成立省一级的整治“层层加码”问题专班。
公众留言板上线后，民众关心投诉之后能不能得到快速有效地解决？对此，在留言板上线当天，程有全回应说，目前，国务院联防联控机制综合组依据群众投诉举报受理、转办、处置、跟踪、督办等流程，与省级联防联控机制建立了密切的联系机制，要求省级专班要认真核实处理国务院联防联控机制综合组和各相关成员单位转办的问题线索，并按要求及时反馈。
省级整治“层层加码”问题专班要及时核查问题线索，盯着办、督着改，以点带面、举一反三，防止类似问题再次发生。对整改不力、影响恶劣的要加强重点督办，确保群众反映的问题得到及时、妥善解决。必要时，国务院联防联控机制综合组和国家相关部门将进行督导、约谈。
收到各地违反“九不准”的投诉后，国务院联防联控机制均及时转地方核查处理。据通报，截至7月7日上午10时，共收到各省办理反馈信息13862件，其中2253件正在办理中。办结了11609件，办结率为83.7%，整治工作取得阶段性成效。
程有全表示，下一阶段将持续推进专项整治工作，按照整治“层层加码”专班的工作机制，继续做好线索收集、转办核实、跟踪督办、通报曝光等工作，做到全面收集、及时转办、全力核查、坚决整改，妥善解决“九不准”相关问题，切实维护人民群众的利益。