9月18日上午，俄罗斯国防部发表声明称，17日23时左右，该国一架伊尔-20侦察机返回赫梅米姆基地途中，在地中海上空距离叙利亚海岸35公里处失联，机上14人下落不明。

　　目前地中海地区集结着美、英、法等国的大量军舰和战机，该侦察机的失踪时间可谓相当敏感。因为俄罗斯国防部声明提到，俄侦察机失联期间，俄空军基地雷达监测到4架以色列战机对叙利亚拉塔基亚省实施空袭，位于地中海东海岸附近的法国护卫舰也有导弹发射活动，而叙政府军用防空系统拦截了部分导弹。因此，关于俄罗斯这架伊尔-20侦察机被谁击落的问题，一时间闹得沸沸扬扬。

　　俄发布这一声明后，各方纷纷撇清关系。美国五角大楼18日称，美军并未介入叙利亚拉塔基亚地区的军事打击行动。法国军方也迅速表示，俄军机失联与法国毫无关系。

　　众说纷纭之际，俄罗斯国防部发言人科纳申科夫少将18日下午宣布，失联的俄伊尔-20侦察机被叙利亚政府军S-200防空导弹击落。可俄罗斯是叙利亚政府军坚定的支持者，叙利亚政府军许多武器装备是由俄罗斯提供，叙攻击俄军机似乎不符合常理。

　　对此，俄罗斯国防部给出回应，叙利亚的S-200防空导弹击落俄罗斯伊尔-20，以色列应负全部责任。原来，在伊尔-20失联当晚，以色列对叙利亚发动新一轮的空袭，对拉塔基亚省境内的多个军事目标进行轰炸。叙防空部队迅速还击。据科纳申科夫称，以色列F-16战斗机飞行员利用俄方伊尔-20侦察机做掩护，将其置于叙利亚防空导弹系统的火力打击之下，因此，比F-16拥有更大有效雷达反射面的伊尔-20就被叙军方S-200防空系统发射的导弹击落。科纳申科夫还指出，以色列航空控制管理设备和F-16战斗机飞行员不可能没发现俄军伊尔-20侦察机，因为当时该侦察机是从5000米的高度进入着陆的，尽管如此，以方还是有意制造了该起事件。

　　以色列在撇清关系的同时，声称其战机在空袭拉塔基亚之前，已通过“热线”告知俄罗斯。但俄国防部表示，以色列并未预先通知驻叙俄罗斯军队指挥部，俄军方在打击前不到一分钟才通过“热线”收到通知，这么短的时间根本来不及让伊尔-20安全撤离。俄方认为以色列的行为具有敌意，将保留采取回应行动的权利。

　　9月18日，俄罗斯总统普京与到访的匈牙利总理欧尔班·维克多举行会晤，并在会后新闻发布会上回应俄军机被击落事件时表示，“这场（意外）像是由一连串悲剧性偶然因素所致，以色列战机没有击落俄伊尔-20”，普京还表示，俄罗斯将查清此事，并采取有效措施保护驻叙俄军的安全。普京强调，不能将此次事件与之前的苏-24战机被击落相比较，“当时土耳其的战斗机故意击落了俄罗斯战机，而以色列没有”。2015年，一架土耳其F-16战机发射导弹击落了一架在叙的俄苏-24战机，随后引发两国之间的外交争端。

　　9月20日，以色列空军司令少将阿米卡姆·诺金率领代表团前往莫斯科，此次行程正是为了向俄方表达歉意，并帮助俄方共同调查。